Oddelenie projektov zo ŠF a infraštruktúrnych projektov
sa spolupodieľa na koordinácií aktivít v oblasti strategického plánovania a rozvoja. Buduje a koordinuje spoluprácu s regionálnymi inštitúciami verejnej správy a inými regionálnymi aktérmi, monitoruje aktuálne výzvy riadiacich a sprostredkovateľských orgánov pre štrukturálne fondy Európskej únie, granty a možností zapájania sa univerzity do projektov. Zabezpečuje metodickú pomoc a koordináciu činností pri príprave projektov spolufinancovaných zo štrukturálnych fondov Európskej únie, v prípade dostupných kapacít aj samostatnú prípravu týchto projektov. Poskytuje odborné konzultácie projektovým manažérom a členom projektových tímov počas implementácie schválených projektov spolufinancovaných zo štrukturálnych fondov Európskej únie. Koordinuje aktivity projektových manažérov v súlade s aktivitami projektu a usmerňuje ich činnosti v zmysle prijatých metodík platných pri implementácií projektov. Implementuje schválené univerzitné projekty v spolupráci s projektovým tímom. Komunikuje s partnerskými inštitúciami počas celého životného cyklu projektu. Vykonáva internú kontrolu a priebežný monitoring schválených projektov štrukturálnych fondov Európskej únie univerzity. Spracováva prehľady, výstupy, implementovaných projektov v gescii oddelenia. Spolupodieľa sa na ekonomickej agende schválených projektov zo štrukturálnych fondov Európskej únie, pripravuje a archivuje žiadosti o platby, usmerňuje finančné aktivity projektového manažéra v súlade so schváleným rozpočtom projektu.