Metodicky riadi a koordinuje činnosti jednotlivých fakúlt  na úseku vedy, akreditácie, umeleckej činnosti a športovej činnosti,  zabezpečuje agendu súvisiacu s organizovaním, koordinovaním a financovaním vedy, umeleckej činnosti a športovej činnosti, spracováva prehľady výskumných projektov a grantov za univerzitu, pripravuje podklady pre riadiace orgány univerzity. Riadi proces akreditácie univerzity. 

a) Referát pre vedu, umenie a šport je pracoviskom prorektora pre vedu, umenie, a šport a pre administratívnu a organizačnú prácu. Administratívne a organizačne zabezpečuje činnosť vedeckej rady univerzity. Zabezpečuje agendu pre prípravu podkladov týkajúcich sa vedy, habilitácií a vymenovacích konaní na univerzite pre vedeckú radu a Ministerstvo školstva, vedy, výskumu a športu Slovenskej republiky. Spracováva agendu pre priznávanie vedecko-akademických titulov, čestných titulov (Dr.h.c., profesor emeritus) a medailí. Spracováva analýzy štatistických výkazov v oblasti vedy, umeleckej činnosti a športovej činnosti, koordinuje aktivity univerzity v oblasti vedecko-výskumných projektov v rámci výziev APVV, KEGA, VEGA, poskytuje konzultačnú a poradenskú činnosť v oblasti vedy pre vysokoškolských učiteľov a študentov univerzity,  podieľa sa na činnostiach súvisiacich s prípravou slávnostných podujatí univerzity.

b) Referát pre akreditáciu a edičnú činnosť zabezpečuje agendu pre prípravu podkladov pre Slovenskú akreditačnú agentúru pre vysoké školstvo, metodicky riadi a koordinuje činností agend fakúlt univerzity na úseku akreditácií, realizuje prideľovanie ISBN v rámci fakúlt univerzity, koordinuje a riadi edičnú a vydavateľskú činnosť univerzity, vedie evidenciu publikačnej činnosti, zabezpečuje zverejnenie materiálov pre akreditáciu a edičnú činnosť na univerzitných webových stránkach, podieľa sa na činnostiach, súvisiacich s vedecko-výskumnou, umeleckou činnosťou a športovou  činnosťou.

c) Referát pre medzinárodné výskumné projekty zabezpečuje agendu spojenú so Siedmym rámcovým programom výskumu a technického rozvoja a Horizontom Európa, koordináciu, prenos informácií a komunikáciu s fakultami, pracoviskami univerzity, zahraničnými partnermi a spoluprácu s Európskou komisiou. Referát zároveň pokrýva organizačné zabezpečenie a aktivity Centra pre komercializáciu výstupov výskumu a manažment duševného vlastníctva Prešovskej univerzity.

Kontaktný bod poradenskej služby pre projekty:

• VEGA
• KEGA
• APVV
• AV MŠ
• Cost
• Horizont Európa
• GA PU
• domáce a zahraničné projekty aplikovaného výskumu