Na pracovných počítačoch, ktoré sú majetkom Prešovskej univerzity je štandardne antivírusová ochrana riešená programom Windows Defender, ktorý poskytuje komplexnú vstavanú a nepretržitú ochranu. Jednotlivé pracoviská si môžu zo svojich zdrojov riešiť doplnkovú antivírusovú ochranu podľa svojich potrieb.