Gréckokatolícka teologická fakulta Prešovskej univerzity v Prešove (v latinskom
      jazyku „Facultatis Theologiae Graecae Catholicae Universitatis Presoviensis“) je
      pokračovateľkou Teologickej akadémie, ktorú v roku 1880 založil prešovský biskup
    ThDr. Mikuláš Tóth, a ktorej činnosť bola ukončená pri násilnej likvidácii
  Gréckokatolíckej cirkvi v Československu v roku 1950.

Štúdium katolíckej teológie sa v Prešove obnovilo až v roku 1990, keď bola fakulta zaradená do zväzku Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach. Zákonom č. 361/1996 Z. z. o rozdelení UPJŠ v Košiciach dňom 1. 1. 1997 bola zriadená Prešovská univerzita v Prešove, ktorej súčasťou sa stala aj Gréckokatolícka teologická fakulta, ktorá od 1. 9. 2005 nesie názov Gréckokatolícka teologická fakulta. Kongregácia pre katolícku výchovu v Ríme vyhlásila Gréckokatolícku teologickú fakultu za cirkevnú dňa 28.10. 2014 a to dekrétom č. 1013/2011.

Z hľadiska kánonického práva sa fakulta riadi apoštolskou konštitúciou Jána Pavla II. Sapientia Christiana, vydanou dňa 15. apríla 1979, a Ordinationes Kongregácie pre katolícku výchovu z 29. apríla 1979, ktoré sú priložené k samotnej Konštitúcii, a normami Kódexu kánonov východných cirkví (kán. 646 – 650; ďalej len „CCEO“) a Veritatis Gaudium – apoštolskou konštitúciou pápeža Františka o univerzitách a cirkevných fakultách.

Vzdelávanie na fakulte je spojené s tvorivo-filozofickým a vedeckým poznaním v oblastiach prednášaných disciplín a im príbuzným oblastiam vedy a školskej praxe. Osobitnou úlohou fakulty je predovšetkým starať sa o vedeckú a teologickú prípravu tých, ktorí smerujú ku kňazstvu alebo sa pripravujú na rozličné cirkevné i spoločenské služby. V tom zmysle poskytuje vysokoškolské vzdelanie v akreditovaných študijných programoch vo všetkých troch stupňoch vysokoškolského vzdelávania.

Základnou organizačnou zložkou fakulty sú štyri katedry:
- Katedra filozofie a európskych štúdií
- Katedra systematickej teológie
- Katedra historických vied
- Katedra spoločenských a humanitných vied

Činnosť dekanátu zabezpečujú: prodekan pre vedu, vonkajšie vzťahy, rozvoj a marketing a prodekan pre vzdelávanie, akreditáciu a hodnotenie kvality.

Administratívnu činnosť jednotlivých organizačných zložiek fakulty zabezpečujú príslušné sekretariáty a oddelenia podľa oraganizačného poriadku.