Laboratórium molekulárnej ekológie živočíchov a biodiverzity rozširuje doterajšie zameranie hydrobiologického výskumu ako jedného z formujúcich smerov katedry ekológie Prešovskej univerzity o nové metodologické postupy založené na molekulárnej ekológii. Tým sa rozširuje výskum biodiverzity na všetky tri úrovne - okrem druhovej a medzidruhovej aj na vnútrodruhovú. Ťažisko výskumu je zamerané na vodné živočíchy (ryby, vodný hmyz) s perspektívou pre ďalšie živočíšne skupiny. Prenosom poznatkov do praxe dôjde k prehĺbeniu kooperácie so spoločenskou a hospodárskou praxou. Laboratórium rozšíri možnosti spolupráce so špičkovými  pracoviskami doma i v zahraničí a možnosti vstupov do medzinárodných sietí.

 Laboratórium molekulárnej ekológie živočíchov a biodiverzity má stanovené nasledujúce ciele:

• sledovanie diverzity druhov vo vzťahu k fungovaniu ekosystémov,
• analýza genetického materiálu autochtónnych populácií živočíchov,
• ochrana pôvodných organizmov a boj proti rôznym typom invázií.

Ďalším cieľom centra je vytvoriť príležitosti pre mladých výskumných pracovníkov, doktorandov a študentov, uskutočňovať výskum na experimentálnych zariadeniach, ktorými disponujú európske a svetové výskumné inštitúcie, čo sa prejaví zvýšenou úspešnosťou pri získavaní zahraničných pobytov. Intelektuálny a infraštruktúrny potenciál sa výrazne premietne do študijných programov fakulty a univerzity, so silným synergickým efektom prezentovaným kreovaním moderných foriem vzdelávania v rámci univerzitných a medziuniverzitných programov. Expertízna báza bude predstavovať potenciál na vytváranie rôznych foriem vzdelávania, ktoré môžu pružne reagovať na požiadavky praxe.

 Laboratórium molekulárnej ekológie živočíchov a biodiverzity používa tieto molekulárne biotechnológie:

Izolácia DNA, elektroforetická separácia, polymerázová reťazová reakcia (angl. polymerase chain reaction, skratka PCR), sekvenovanie DNA, identifikácia polymorfizmov, detekcie mikrosatelitných segmentov pre overovanie pôvodu živočíchov a určenie príbuzenských vzťahov.

Jednotlivé molekulárne ekologické metódy budeme aplikovať pre spoločenstvá vodných stavovcov ako aj bezstavovcov. Z rybích populácií bude v najbližšej budúcnosti pozornosť zameraná najmä na druhy rodu Gobio a Romanogobio, teda našich pôvodných zástupcov hrúzov, vrátané ich krížencov. Ďalšou skupinou sú rody z čeľade pĺžovité (Cobitidae) (t.j. Cobitis, Sabanejewia, Misgurnus). Zo skupiny vodných bezstavovcov sa venujeme bentickým (najmä dominantným radom: Plecoptera, Ephemeroptera, Trichoptera) a planktonickým (Cladocera, Copepoda, Rotatoria) živočíchom.

Infraštruktúra laboratória:

• elektroforéza s príslušenstvom
• laboratórny mikroskop - trinokulárny výstup
• stereomikroskop
• termobloky
• termocyklér
• transluminátor a dokumentačný systém (Digimage System)
• autokláv
• UV prietokový čistič
• UV Lampa (Germicídny žiarič)
• DNA/RNA UV čistič
• vertikálny laminárny box
• filtračné zariadenie na úpravu vody
• Software – CodonCode, Eutaxa Ephemeroptera, Eutaxa Trichoptera, Eutaxa MZB Families