Katedra psychológie bola zriadená na Filozofickej fakulte vtedajšej Univerzity P. J. Šafárika v Košiciach v roku 1968. Jej história pokračuje od roku 2005 pod názvom Inštitút psychológie. V Košiciach sídlila katedra v historickej budove bývalej košickej Kráľovskej akadémie (1657) na terajšej Hlavnej ulici č. 67. Jej zakladateľom a dlhoročným vedúcim bol Prof. PhDr. Ján Hvozdík, DrSc. Pod jeho vedením katedra úspešne rozvíjala vedeckú a pedagogickú činnosť do roku 1984.

V roku 1984 sa Katedra psychológie presťahovala do Prešova. Profesora Hvozdíka vo vedení katedry vystriedala Doc. PhDr. Ľudmila Fábryová, CSc. Od roku 1989 viedol katedru Doc. PhDr. Viliam Kubáni, CSc. a po ňom od začiatku roku 1990 prevzal vedenie Doc. PhDr. Ján Ferjenčík, CSc. V školskom roku 1991/92 sa Katedra psychológie opäť vrátila do Košíc, kde sídlila na Moyzesovej ulici č. 50. V roku 1995 odstúpil z funkcie vedúceho katedry Doc. PhDr. J. Ferjenčík, CSc. a vedením katedry bol do 31. 12. 1998 poverený Doc. PhDr. Štefan Vendel, CSc. Od 1. januára 1999 sa vedúcou katedry stala Doc. PhDr. Viera Bačová, CSc.

Po vzniku Prešovskej univerzity so sídlom v Prešove sa Katedra psychológie stala súčasťou Filozofickej fakulty Prešovskej univerzity. Ako detašované pracovisko bola alokovaná v Košiciach do 30. júna 1999. Od 1. septembra školského roku 1999/2000 dostala Katedra psychológie priestory v sídle fakulty a univerzity v Prešove.

V súvislosti so vznikom novej organizačnej štruktúry Filozofickej fakulty Prešovskej univerzity v Prešove sa v roku 2005 katedra psychológie transformovala na inštitút psychológie s členením na tri katedry: Katedra základných psychologických vied a psychologickej metodológie, Katedra klinickej psychológie a psychológie zdravia a Katedra školskej psychológie, poradenskej psychológie a psychológie práce. Riaditeľom Inštitútu psychológie FF PU v Prešove sa stal Doc. PhDr. Jozef Džuka, CSc., m.prof., vo funkcii riaditeľa ďalej pôsobili doc. PhDr. Miroslav Skorodenský, CSc. a doc. PhDr. Štefan Vendel, CSc.

V súčasnosti (od 1.septembra 2013) je riaditeľom inštitútu Doc. Mgr. Peter Babinčák, PhD.